L'histoire des Apparitions commence le 13 mai 1917, trois enfants faisaient paître un petit troupeau à la Cova da Iria, paroisse de Fátima, conseil de Vila Nova de Ourém, aujourd’hui diocèse de Leiria-Fátima. Ils s’appelaient Lucie de Jesus, 10 ans, François et Jacinthe Marto, ses cousins de 9 et 7 ans. Vers midi, après avoir récité le rosaire, comme habituellement, ils faisaient passer le temps en construisant une petite maison en pierres sèches, à l’endroit où se trouve aujourd’hui la Basilique. Soudain, ils ont vu une lumière très brillante ; pensant que c’était un éclair, ils ont décidé de partir, mais plus bas, un autre éclair illumine l’espace et ils ont vu sur un petit chêne vert, une « Dame plus brillante que le soleil », avec un chapelet blanc qui pendait de ses mains. La Dame a dit aux trois petits pastoureaux qu’il était nécessaire de beaucoup prier et les a invités à revenir encore à la Cova da Iria pendant cinq mois consécutifs, le 13 et à la même heure. Les enfants firent ainsi, et les 13 juin, juillet, septembre et octobre, la Dame leur est de nouveau apparue et leur a parlé, à la Cova da Iria. Lors de la dernière apparition, le 13 octobre, étaient présentes environ 70.000 personnes, la Dame leur a dit qu’Elle était la « Dame du Rosaire » et leur a demandé de faire construire à cet endroit une chapelle en Son honneur. La construction de la Chapelle fut la réponse à la demande de Notre-Dame de Fátima « je veux que l’on construise ici une chapelle en mon honneur ». Construite en 1919 sur le lieu des apparitions, du 28 avril au 15 juin, la première Messe y fut célébrée le 13 octobre 1921. Postérieurement, la Sœur Lucie étant alors religieuse de la Congrégation Sainte Dorothée, la Sainte Vierge lui est encore apparue en Espagne, demandant la dévotion des cinq premiers samedis et la Consécration de la Russie au même Cœur Immaculé. Des années plus tard, la Sœur Lucie raconte encore qu’entre avril et octobre 1916, un Ange était apparu trois fois aux trois voyants, les invitant à la prière et à la pénitence. Depuis 1917, des milliers et des milliers de pèlerins venus du monde entier, n’ont pas cessé d’aller à la Cova da Iria.